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title: "R与(R)Markdown基础"
subtitle: "中南大学 生物医学信息系 本科/研究生课程"
description: "掌握R语言核心语法与可重复性研究报告撰写技能"
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# R与(R)Markdown基础

## R and (R)Markdown Fundamentals

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中南大学 · 生物医学信息系 · 本科/研究生课程
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## 开始学习 {.text-center .mt-4 .mb-5}

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[📋 课程大纲](syllabus.qmd){.btn .btn-primary .btn-lg .me-2}
[🧪 实验1：R基础](labs/lab1-r-basics.qmd){.btn .btn-success .btn-lg .me-2}
[🧪 实验2：R Markdown](labs/lab2-rmarkdown.qmd){.btn .btn-success .btn-lg .me-2}
[📚 学习资源](../learning-resources.html){.btn .btn-info .btn-lg}
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**幻灯片**：
[📊 R语言基础](slides/slides-r-basics.html){.btn .btn-outline-secondary .btn-sm .me-1}
[📊 R Markdown与现代报告工具](slides/slides-rmarkdown.html){.btn .btn-outline-secondary .btn-sm}
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## 课程简介 {.text-center .mb-5}

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本课程面向**生物医学信息系**本科生/研究生，系统讲授 **R语言基础语法** 与 **(R)Markdown文档编写** 技术。通过"2学时理论讲授 + 2学时实验操作"的紧凑安排，帮助学生：

- 掌握R语言核心编程技能
- 熟悉生物医学数据处理常用包
- 学会使用R Markdown/Quarto撰写可重复性研究报告
- 建立良好的计算生物学研究习惯

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## 课程模块 {.text-center .mb-4}

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### 📊 理论讲授 (2学时 = 90分钟)

| 内容 | 时长 | 要点 |
|------|:----:|------|
| **R语言基础** | 50分钟 | 数据类型、结构、控制流、函数、R包生态 |
| **R Markdown基础** | 25分钟 | 语法、代码块、输出控制 |
| **现代报告工具** | 15分钟 | Quarto、可重复性研究 |

[查看详细大纲](syllabus.qmd){.btn .btn-outline-primary .btn-sm .mt-2}
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::: {.col-md-6}
::: {.course-card}
### 🧪 实验操作 (2学时 = 90分钟)

| 实验 | 时长 | 目标 |
|------|:----:|------|
| **实验1：R基础** | 45分钟 | 数据操作、可视化、编程练习 |
| **实验2：报告撰写** | 45分钟 | 完整分析报告的R Markdown实现 |

配套实验指导手册、示例数据、参考答案

[进入实验指导](labs/lab1-r-basics.qmd){.btn .btn-outline-primary .btn-sm .mt-2}
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## 你将学到什么 {.text-center .mt-5 .mb-4}

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### 💻
**R编程**
向量、矩阵、数据框、列表操作；条件判断与循环；自定义函数
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::: {.col-6 .col-md-3}
::: {.p-3}
### 📦
**核心包**
tidyverse数据处理；ggplot2可视化；生物医学专用包
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::: {.col-6 .col-md-3}
::: {.p-3}
### 📝
**文档编写**
Markdown语法；R Markdown文档结构；交叉引用与自动化
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::: {.col-6 .col-md-3}
::: {.p-3}
### 🚀
**现代工具**
Quarto多格式输出；Git版本控制；可重复性研究最佳实践
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## 授课教师 {.mt-5}

::: {.instructor-card}
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![](../logo/wsx.jpeg){style="width: 100%; height: 100%; object-fit: cover;"}
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::: {.instructor-info}
### 王诗翔 副教授

**中南大学 · 生物医学信息系**

研究方向：生物信息学、计算生物学、多组学数据分析

🌐 [实验室主页](https://wanglabcsu.github.io/)  
📧 wangshx@csu.edu.cn  
🐙 [WangLabCSU](https://github.com/WangLabCSU)
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## 课程特色 {.mt-5}

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::: {.feature-box}
#### 🎯 面向实战
所有内容紧密结合生物医学研究场景，代码示例可直接用于实际项目
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::: {.col-md-4}
::: {.feature-box}
#### 🔗 前后衔接
本课程为后续《转录组分析》《基因组突变分析》等课程奠定基础
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::: {.col-md-4}
::: {.feature-box}
#### 📚 资源丰富
提供完整的幻灯片、实验指导、示例代码、拓展阅读材料
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**中南大学 · 生物医学信息系**  
*Department of Biomedical Informatics, Central South University*

本课程网站使用 [Quarto](https://quarto.org) 构建 · 
[GitHub 仓库](https://github.com/WangLabCSU/courses/tree/main/r-and-rmarkdown) · 
[实验室主页](https://wanglabcsu.github.io/)

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